プロフィール

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はじめまして，マサチューセッツ工科大学 (MIT) コンピュータ科学・人工知能研究所 (CSAIL) にてポスドク研究員をしている谷川洋介と申します。現在，Dr. Manolis Kellis 先生の主宰する Computational Biology Lab にて大規模ゲノミクス・エピゲノミクスの研究に従事しています。

履歴書はCVに，研究成果の一覧はPublicationsに掲載されています。また，データセット，ソフトウェアなどをResourcesにて公開しています。可能な限り，最新の情報をウェブサイトに掲載するようにつとめていますが，万一更新が滞ってしまっている場合は，Google Scholar profileの論文のリストもあわせてご参照いただければ幸いです。

略歴

• 2012年4月 東京大学 教養学部 理科二類 入学
• 2014年4月-2016年3月 東京大学 理学部 生物情報科学科 卒業
  • 卒業研究では，森下真一先生にご指導いただきました
• 2016年9月-2021年6月 スタンフォード大学 Biomedical Informatics 博士課程 修了 (Ph.D.)
  • 博士論文: “Large-scale genomic inference of multiple phenotypes”, 博士論文公聴会
  • 指導教員: Dr. Manuel Rivas 先生, Dr. Gill Bejerano 先生
• 2021年7月- マサチューセッツ工科大学 (MIT) ポスドク研究員
  • 指導教官: Dr. Manolis Kellis 先生

主な研究内容

• 統計遺伝学 の手法を用いた，ヒトゲノムの研究（とくに，バイオバンクを用いた，解析手法の開発と応用に興味を持っています）
  • N. Sinnott-Armstrong*, Y. Tanigawa*, et al., Nature Genetics. (2021).
  • Y. Tanigawa, et al., PLOS Genetics. 16, e1008682 (2020).
  • G. McInnes, Y. Tanigawa, et al., Bioinformatics 35(14), 2495-2497 (2019).
• ヒトゲノム研究への応用を見据えた，大規模データのための統計解析手法の開発
  • Y. Tanigawa*, J. Li*, et al., Nat Commun. 10, 4064 (2019).
  • J. Qian, Y. Tanigawa, et al., PLOS Genetics. 16, e1009141 (2020).
  • J. Qian, Y. Tanigawa, et al., bioRxiv, 2020.05.30.125252 (2020).
• ヒトゲノムに含まれる，非コード領域の機能の解析（とくに，転写因子のはたらきに興味を持っています）
  • Y. Tanigawa*, E. S. Dyer*, G. Bejerano, bioRxiv, 730200 (2019).

人類遺伝統計学や，その応用に関わる統計解析手法については，和文総説「複数の表現型を用いた人類遺伝統計学の大規模情報解析」においても取り上げました。よろしければ、あわせてご参照ください。

主な受賞歴等

• 2018, 2021年 Reviewers’ Choice Abstract Award, the American Society of Human Genetics Annual Meeting
• 2020年9月 最優秀口頭発表賞 日本バイオインフォマティクス学会年会・第9回生命医薬情報学連合学会 (発表資料)
• 2017, 2018, 2019年 Stanford University. Biosciences office of the graduate education travel grant 採択
• 2016年7月 The Helmsley Charitable Trust, Helmsley Interdisciplinary Fellowship 採択
  • Cold Spring Harbor Laboratory でのサマースクール “Chromatin, Epigenetics, and Gene Expression” の参加の一部を補助していただきました
  • サマースクール参加の様子は，第1回の留学レポートに報告させていだています（pdf 2ページめ）。
• 2016年5月 公益財団法人 船井情報科学振興財団 2016年度 Funai Overseas Scholarship 採択
  • 船井情報科学振興財団による Funai Overseas Scholarship
  • 留学レポートが，財団のホームページに掲載されています
• 2016年3月 東京大学 理学部 平成27年度 理学部学修奨励賞
• 2014年6月 東大友の会 Global Leadership Award
  • UC Berkeley でのサマースクールへの参加費用の一部を補助していただきました。財団のホームページにレポートが掲載されています。

学修・研究活動への様々なご支援に，深く感謝します。ありがとうございます。

このウェブサイトにある日本語のコンテンツ

• Stanford での大学院生活・大学院出願準備に関するリソース
• 船井情報科学振興財団による Funai Overseas Scholarship
• 生物情報科学科での学部教育
• COVID-19 host genetics に関する研究 (2020年4月時点での情報です)
• 高校生への科学アウトリーチ活動
• 発表資料 - 2020年日本バイオインフォマティクス学会年会・第9回生命医薬情報学連合学会
• （和文総説）複数の表現型を用いた人類遺伝統計学の大規模情報解析 (Large-scale human genetic statistical inference with multiple phenotypes), JSBi bioinformatics review, 1(2), 47-59 (2021)。GWAS、polygenic risk score、高次元データセットでの penalized regression (Lasso など) に関する人類統計遺伝学の解析手法について執筆しました。
• その他の日本語ページの一覧

連絡先

私の活動内容に興味を持っていただき，ありがとうございます。 下記の電子メールアドレスに，所属とお名前を明らかにして，ご連絡ください。 2日間以内に返信がない場合は，お手数ですが，再度連絡をいただければ幸いです。

• Email: yosuke <dot> tanigawa [at] alumni <dot> stanford <dot> edu
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